中国科学院生态环境研究中心拥有环境科学、环境工程、生态学、分析化学、有机化学、环境经济与环境管理专业博士学位点，环境科学、环境工程、生态学、分析化学、有机化学、环境经济与环境管理硕士学位点，资源与环境、生物与医药专业学位硕士点。1998年被评为中国科学院博士研究生教育重点培养基地。在教育部第四轮和第五轮学科评估中，环境科学与工程、生态学、化学三个一级学科均获评A+。

　　中心拥有雄厚的师资力量，目前博士生导师139人、硕士生导师120人，包括中国科学院院士3人、中国工程院院士2人，国家杰出青年科学基金获得者23人，国家优秀青年科学基金获得者30+5人（海外），“新世纪百千万人才工程”国家级人选 6 人。自1978年恢复研究生招生以来，共招收研究生4330名，其中硕士研究生1643名，博士研究生2687名；已授硕士学位1249人，授博士学位2153人；中心充分发挥科教融合优势，为培养一流人才提供重要平台和支撑，向高校、科研院所、政府部门、企事业单位等输送了大批生态环境领域优秀的科技、管理人才。目前在读博士研究生566名，在读硕士研究生341名。自2004年开始招收留学生，目前有来自斯里兰卡、埃及等留学生32人。

　　近十年，中心有11名毕业生获中国科学院院长奖学金特别奖，42名毕业生获中国科学院院长奖学金优秀奖，12名毕业生入选中国科学院优秀博士学位论文，175人获得国家奖学金，76人获得北京市优秀毕业生荣誉称号，77人次获得中国科学院和中国科学院大学冠名奖等各类奖励和表彰。